Como ejercicio de esta sección os sugiero que escribáis un programa que tome un grupo
de proteínas o de ácidos nucleicos de la misma familia, en formato FASTA, y calcule
mediante el programa
bl2seq
,
del paquete BLAST, una matriz de similaridad de
todas las secuencias contra todas. Finalmente, basándoos en la matriz, el programa
deberá crear un árbol que represente las distancias de todas las secuencias a una
elegida por el usuario.
Bruno Contreras-Moreira